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Nat. Comp. Sci. | 警惕大模型的过度自信陷阱—清华大学王童组应邀述评蛋白质语言模型预测新
蛋白质适应度用于量化单个氨基酸突变对蛋白质功能改变与表型修饰的诱导程度，是探究生物学底层机制、开展理性蛋白质设计以及酶工程改造的重要基础。尽管深度突变扫描是当前...
DrugOne 3小时前2026-07-17 21:07:09
基础、模型、设计、性能、nat
Nat. Comput. Sci. | 面向信息超材料设计的生成式模型
信息超材料是一类将数字编码、电磁波调控与信息处理深度融合的新型人工人工程材料，能够实现波束调控、近场聚焦、全息成像等多种电磁功能。然而，这类材料的逆向设计需要同...
DrugOne 3小时前2026-07-17 21:06:30
优化、nat、编码、模型、设计
Nat. Chem. Biol. | 蛋白质稳定性主要由单位点偏倚而非位点间协方差决定
近年来，基于多序列比对的Potts模型被广泛用于蛋白质设计和突变效应预测。传统观点认为，多序列比对中既包含单位点保守性，也包含残基之间的协同进化信息，两者共同决...
DrugOne 2天前2026-07-15 14:09:31
模型、设计、统计、优化、nat
JACS Au | SynPROTAC模型实现可合成PROTAC分子的理性设计
蛋白质降解靶向嵌合体（PROTAC）作为一种新兴的疾病相关蛋白降解技术，在药物发现领域展现出巨大潜力。然而，其复杂的双功能分子结构使得设计兼具高生物活性和良好合...
DrugOne 3天前2026-07-14 13:33:34
强化学习、模型、设计、数据、优化
Nucleic. Acids Res.| 概率扩散驱动的AI药物设计：从靶标结构感知到亲和力驱动再到保守相互作用引导
先导化合物优化连接着早期命中与临床候选，是药物发现中依赖结构洞察、化学经验与反复试验的关键环节。传统配体生成模型多从已知分子的二维表示或配体分布中学习，难以充分...
DrugOne 3天前2026-07-14 13:33:00
模型、设计、优化、开发、框架
Nature | 通用细胞嵌入构建细胞生物学基础模型
随着单细胞RNA测序技术的发展，研究人员已经构建了覆盖多种组织、发育阶段和物种的大规模细胞图谱，为建立统一的细胞表示空间提供了前所未有的数据基础。然而，不同实验...
DrugOne 4天前2026-07-13 11:26:33
数据、算法、迁移、基础、模型
Nat. Comput. Sci. | 融合细胞学图像与空间转录组学的细胞分割方法
空间转录组技术的快速发展，使研究人员能够在组织原位测量基因表达，并逐步达到亚细胞乃至单细胞分辨率。然而，要将分散在组织空间中的转录本准确归属于单个细胞，首先需要...
DrugOne 4天前2026-07-13 11:26:19
模型、数据、网络、优化、nat
Nat. Commun. | 智能体智能与真实世界数据赋能临床试验设计
临床试验设计通常耗时长、成本高，并高度依赖医学、统计学和数据科学专家的反复协作。真实世界数据，尤其是电子健康记录，包含大量来自临床实践的证据，可用于优化临床试验...
DrugOne 4天前2026-07-13 11:25:56
统计、系统、nat、设计、数据
Nucleic. Acids Res. | DeepAden: 基于深度学习的NRPS腺苷化结构域底物特异性预测方法
在天然产物研究中，非核糖体肽（NRP）是一类结构多样、活性丰富的重要天然产物，是临床药物先导化合物的重要来源。NRP的生物合成依赖于非核糖体肽合成酶（NRPS）...
DrugOne 4天前2026-07-13 11:25:47
模型、数据、性能、深度学习、工作
专题 | 金属结合蛋白的计算设计
金属结合蛋白能够参与多种生命过程，而金属在其中扮演着至关重要的角色。早在1996年，Holm等人就总结了金属结合位点的五大功能1。分别是：稳定蛋白质结构，调节蛋...
DrugOne 4天前2026-07-13 11:25:41
深度学习、工作、模型、设计、搜索
Nat. Mach. Intell. | 强化学习引导生成模型发现新型晶体结构
晶体材料发现需要在巨大的组合设计空间中寻找兼具新颖性、稳定性和潜在功能性的候选物。近年来，生成式人工智能已经能够采样化学上看似合理的晶体组成和结构，但仍面临一个...
DrugOne 4天前2026-07-13 11:22:05
nat、模型、设计、优化、强化学习
Nat. Biomed. Eng. | 临床思维链引导的骨转移全身骨骼基础模型
骨转移发病率不断上升，CT 因快速、低成本且可及性高，常作为骨转移筛查和初步评估的重要影像手段。然而，骨转移的精准诊断并不只是识别 CT 上是否存在骨病灶，还需...
DrugOne 10天前2026-07-07 17:55:55
事件、数据、nat、基础、模型
npj Digit. Med.｜AI越强大，为什么越需要生物信息学专家？
2026年5月，南洋理工大学、查尔姆斯理工大学、新加坡国立大学、哥德堡大学等机构研究人员在《npj Digital Medicine》发表观点性文章，题为“Re...
DrugOne 10天前2026-07-07 17:55:26
模型、设计、数据、系统、工作
Nat. Mach. Intell. | 深度知识图谱驱动的生物医学证据探索与综合
与通用人工智能体相比，深度研究智能体能够进行更长链条的推理和更深入的文献探索，以研究复杂问题。研究人员提出 DeepEvidence，这是一个面向异质生物医学知...
DrugOne 11天前2026-07-06 15:38:23
设计、搜索、系统、nat、模型
BioMatrix: 一个模型、一套 token，真正原生统一生物序列、结构与语言
近年来，基础大模型正在加速进入生命科学与药物研发领域。从分子生成、蛋白质设计，到分子-蛋白相互作用预测，AI 正在帮助研究者更快地理解复杂生命系统。然而，生物世...
DrugOne 11天前2026-07-06 15:37:44
设计、数据、token、基础、模型
MolSafeEval：揭示人工智能生成分子安全风险的基准
本文作者：Tong Xu（Zhejiang University）,Xinzhe Cao（University of Oxford）,Zhihui Zhu（ZJ...
DrugOne 11天前2026-07-06 15:20:10
人工智能、安全、框架、模型、设计
Nat. Med. | 哈佛医学院、罗氏与浙江大学联合发布COMPASS：可泛化AI预测跨癌种、跨治疗的免疫治疗响应
COMPASS 概念瓶颈架构以“漏斗”意象呈现——将高维基因表达逐层汇聚为可解释的肿瘤免疫概念。（来源：由Daniel Marbach 博士设计与提供）
DrugOne 11天前2026-07-06 15:19:31
模型、设计、原型、nat、队列
MusicMol: 让分子「可听」、让音乐「可合成」——浙大团队提出分子-音乐双向翻译框架
浙江大学药学院申万祥团队提出MusicMol，一个将小分子与符号音乐（MIDI）双向关联的生成框架。在分子→音乐方向，基于条件流匹配的生成器将分子结构映射为MI...
DrugOne 14天前2026-07-03 17:45:44
部署、翻译、框架、设计、数据
Nat. Rev. Bioeng.｜机器学习驱动抗体多目标设计与优化
近日，美国密歇根大学Peter M. Tessier团队在《Nature Reviews Bioengineering》发表综述文章，题为“Multi-obje...
DrugOne 14天前2026-07-03 17:45:38
nat、模型、设计、优化、机器学习
J. Med. Chem. | AI强化学习驱动的从头药物设计: A2A腺苷受体拮抗剂案例研究
本文是一篇方法学透明度较高的AI从头药物设计实证研究。研究团队使用 AstraZeneca 开发、Evotec 定制化改造的生成式工具 REINVENT 3.2...
DrugOne 14天前2026-07-03 17:45:23
强化学习、函数、模型、设计、优化

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个人简介

博士 | AI药物研发、计算生命科学
Data Science and AI Empowered Drug Discovery and Life Science.
python 深度学习机器学习数据挖掘玩转腾讯云
延世大学 | AIDD
https://jianmin2drugai.github.io/
湖南省 | 长沙市
加入社区时间：2021-01-15

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Nat. Comput. Sci. | 面向信息超材料设计的生成式模型

Nat. Chem. Biol. | 蛋白质稳定性主要由单位点偏倚而非位点间协方差决定

JACS Au | SynPROTAC模型实现可合成PROTAC分子的理性设计

Nucleic. Acids Res.| 概率扩散驱动的AI药物设计：从靶标结构感知到亲和力驱动再到保守相互作用引导

Nature | 通用细胞嵌入构建细胞生物学基础模型

Nat. Comput. Sci. | 融合细胞学图像与空间转录组学的细胞分割方法

Nat. Commun. | 智能体智能与真实世界数据赋能临床试验设计

Nucleic. Acids Res. | DeepAden: 基于深度学习的NRPS腺苷化结构域底物特异性预测方法

专题 | 金属结合蛋白的计算设计

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Nat. Biomed. Eng. | 临床思维链引导的骨转移全身骨骼基础模型

npj Digit. Med.｜AI越强大，为什么越需要生物信息学专家？

Nat. Mach. Intell. | 深度知识图谱驱动的生物医学证据探索与综合

BioMatrix: 一个模型、一套 token，真正原生统一生物序列、结构与语言

MolSafeEval：揭示人工智能生成分子安全风险的基准

Nat. Med. | 哈佛医学院、罗氏与浙江大学联合发布COMPASS：可泛化AI预测跨癌种、跨治疗的免疫治疗响应

MusicMol: 让分子「可听」、让音乐「可合成」——浙大团队提出分子-音乐双向翻译框架

Nat. Rev. Bioeng.｜机器学习驱动抗体多目标设计与优化

J. Med. Chem. | AI强化学习驱动的从头药物设计: A2A腺苷受体拮抗剂案例研究

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