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  • 来自专栏生物信息学_troubleshooting

    FeaturePlot_scCustom作图

    在浪费一些时间之后,我发现了有团队推出了FeaturePlot_scCustom() function, 请移步 https://samuel-marsh.github.io/scCustomize/index.html 根据官网的介绍,代码如下:# Show specific features in each sample.p <- FeaturePlot_scCustom(seurat_object = object1 (1:length(p), function(i) p[[i]])所以最终的代码如下:# Show specific features in each sample.p <- FeaturePlot_scCustom

    41210编辑于 2024-07-13
  • 来自专栏生信补给站

    scRNA分析 | 定制 美化FeaturePlot 图,你需要的都在这

    (2)scCustomize 修改 p11 <- FeaturePlot_scCustom(seurat_object = sce2, features = "CD3D") p22 <- FeaturePlot_scCustom ), pt.size = 1, split.by = "sample" ,ncol = 4) (2)scCustomize 中FeaturePlot_scCustom 函数 ,算是修正了这个小bug FeaturePlot_scCustom(seurat_object = sce2, features = "CD3D", split.by = "orig.ident

    12.2K30编辑于 2023-08-25
  • 来自专栏生信技能树

    展示你的特征基因:带"辣椒粉"的markers基因umap图

    #### umap4:scCustomize library(viridis) library(Seurat) library(scCustomize) # 绘图 p <- FeaturePlot_scCustom list p_merge <- list() for(i in 1:length(g)) { # 打印动态 print(g[i]) # 绘图 p_merge[[i]] <- FeaturePlot_scCustom list p_merge <- list() for(i in 1:length(g)) { # 打印动态 print(g[i]) # 绘图 p_merge[[i]] <- FeaturePlot_scCustom

    70800编辑于 2025-03-11
  • 来自专栏生信技能树

    5种方式美化你的单细胞umap散点图

    ############## umap4:scCustomize library(viridis) library(Seurat) library(scCustomize) FeaturePlot_scCustom 当时还专门在群里问了来着哈哈哈哈) 还可以轻松地修改配色: # 修改颜色 # Set color palette pal <- viridis(n = 10, option = "D") FeaturePlot_scCustom

    11K00编辑于 2025-01-11
  • 来自专栏生信技能树

    如何看一堆基因在各个单细胞亚群是否有差异呢?

    aggregated gene set scores using AddModuleScore() function from Seurat and then plotted using FeaturePlot scCustom

    30810编辑于 2024-11-21
  • 来自专栏静默虚空的博客

    Yarn 入门

    yarn add package-2@^1.0.0 yarn add package-3@beta { "dependencies": { "package-1": "1.2.3", "package

    2.4K30发布于 2018-12-07
  • 来自专栏分析工具

    单细胞irGSEA分析:整合多种富集分析方式的R包

    group.by="celltype",label = T);UMAP_celltypeIdents(sc_dataset) <- sc_dataset$celltypescCustomize::DimPlot_scCustom

    1.1K10编辑于 2024-08-16
  • 来自专栏人工智能小咖

    JavaScript中的Monorepos,反模式

    monorepo项目通常会有这样的结构: myproject.git/ packages/ package-1/ package.json package

    2.1K00发布于 2020-04-10
  • 单细胞水平看生存分析相关基因

    celltypeDimPlot(sce, reduction = "umap", label = TRUE, repel = T,pt.size = 0.5) scCustomize::DimPlot_scCustom

    36810编辑于 2024-07-02
  • 来自专栏向治洪

    android应用资源预编译,编译和打包全解析

    假设我们正在编译的是Package-1,这时候我们可以设置另外一个Package-2,用来告诉aapt,如果Package-2定义有和Package-1一样的资源,那么就用定义在Package-2的资源来替换掉定义在

    3.8K111发布于 2018-02-01
  • 来自专栏柒八九技术收纳盒

    你真的了解package.json吗?

    a1b2c3d4e5f6g7h8i9j0k1l2m3n4o5p6q7r8s9t0" package-2@^2.0.0: version "2.0.1" resolved "https://registry.npmjs.org/package

    1.4K10编辑于 2024-02-17
  • 来自专栏网络日志

    你真的了解package.json吗?

    a1b2c3d4e5f6g7h8i9j0k1l2m3n4o5p6q7r8s9t0" package-2@^2.0.0: version "2.0.1" resolved "https://registry.npmjs.org/package

    1.1K10编辑于 2024-05-18
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