本期介绍的是材料化学领域的工具资源: *Pymatgen:材料分析 Python 库 *PubChemPy:化学工具包 *Bert-loves-chemistry:化学建模 *LAMMPS:大规模原子分子并行模拟器 ChemCrow:简化常见化学任务推理 *浦科化学:开源科学大模型 *Open Catalyst Project:挖掘用于可再生能源储存的新催化剂 *Materials Projects:计算材料性质 Pymatgen :材料分析 Python 库 Pymatgen (Python Materials Genomics) 是一个开源的、可用于材料分析的 Python 库,拥有强大的材料分析代码,为结构和分子定义了类别, 资源地址: https://github.com/materialsproject/pymatgen PubChemPy:化学工具包 PubChemPy 依赖于 PubChem 数据库,是一个通过 PUG 目前,其可以为研究人员提供: * Pymatgen:用于材料分析的开源 Python 库,研究人员能够访问 Materials API 进一步分析复杂的材料数据集。
MatGL 基于 Deep Graph Library (DGL) 与 Python Materials Genomics (Pymatgen) 构建,旨在成为一个可扩展、功能齐全的平台,用于开发先进的材料性质预测模型与机器学习原子间势能函数
tools (5.2-1build1) command 'gm2' from deb gm2 (4:11.2.0-1ubuntu1) command 'pmg' from deb python3-pymatgen
4.2 实现细节 使用python库Pymatgen来计算生成数据的所有最近邻距离。在这篇文章中的所有实验距离被修正为d1=1.88Å,d2=3Å。