,激活环境后安装) 三、测试环境 #激活环境运行IPython source activate pydd36 ipython #导入openbabel和RDKit import openbabel, pybel
它是Pybel的扩展,Pybel是一个只提供Open Babel访问权限的Python模块。它允许在应用程序编程接口(API)级别的互操作性,其优点是不需要对现有软件进行任何更改。 它依赖于Pybel、RDKit、Open Babel和MOPAC等其他几个软件包,以提供其完整的功能。它计算出大约16个由19个各种特征组成的特征组,这些特征总共包含大约1,135个描述符。
写一个类然后打包发布,对于使用者来说难度有点大 所以我们就简单介绍一下包的使用和安装,足够大家使用就好 python的一大优势就是有很多的第三方包 •蛋白设计:PyRosetta等 •化学信息学:Rdkit,PyBel