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有可能给超低版本的R安装高配包吗
发现安装最基础包 ggplot2 都失败，如下所示： > install.packages('ggplot2') Warning: dependency ‘mgcv’ is not available bytes (2.9 MB) ================================================== downloaded 2.9 MB ERROR: dependency ‘mgcv ’ is not available for package ‘ggplot2’ 搜索了一下它所依赖的 mgcv 包 ： mgcv: Mixed GAM Computation Vehicle with stats, graphics, Matrix, splines, utils Suggests: parallel, survival, MASS Published: 2021-09-23 确实是因为 mgcv
2K30发布于 2021-10-12 - 来自专栏拓端tecdat
R语言广义相加（加性）模型（GAMs）与光滑函数可视化
mgcv软件包是一套优秀的软件，可以为非常大的数据集指定、拟合和可视化GAMs（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。 相关视频 这篇文章介绍一下广义加性模型（GAMs）目前可以实现的功能。 我们需要加载mgcv library('mgcv') 受欢迎的例子数据集 dat中的数据在GAM相关的研究中得到了很好的研究，包含了一些协变量--标记为x0到x3--这些协变量在不同程度上与因变量有非线性关系 为了拟合一个加性模型，我们使用 gam(y ~ s(x0) + s(x1) + s(x2) + s(x3), dat, "REML") mgcv提供了一个summary()方法，用来提取关于拟合GAM 绘制光滑_函数_图 为了将估计的GAMs可视化，mgcv提供了plot.gam()方法和vis.gam()函数，从对象中产生类似ggplot2的图。 可以处理mgcv可以估计的大多数光滑_函数_，包括带有因子和连续副变量的按变量光滑_函数_、随机效应光滑_函数_（bs = 're'）、二维张量积光滑_函数_，以及带有参数项的模型。
1.5K30编辑于 2023-08-31 - 来自专栏R语言交流中心
R语言实现广义加模型
接下来，我们看下实现模型需要的包： install.packages("mgcv") install.packages("gamRR") 包安装好后，我们看下具体的函数，在mgcv中有两个函数都可以实现 那么我们直接看实例： library(mgcv) library(gamRR) dat <- gamSim(1,100,dist="poisson",scale=.25)#为gam模拟样本数据 fit
3K20发布于 2020-04-14 - 来自专栏优雅R
「R」MacOS 安装 R4.0
Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/ KernSmooth boot compiler graphics mgcv Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/library KernSmooth boot compiler graphics mgcv
2.3K10发布于 2020-07-03 - 来自专栏小汪Waud
R包来源及安装指定版本R包方法
Program Files/R/R-4.0.5/library packages: boot, class, cluster, KernSmooth, lattice, MASS, Matrix, mgcv library packages: boot, class, cluster, codetools, foreign, KernSmooth, lattice, MASS, Matrix, mgcv
15.9K50编辑于 2023-02-03 - 来自专栏科技记者
理解回归分析--机器学习与R语言实战笔记（第四章）
install.packages("mgcv") # gam函数在这个包 library(mgcv) install.packages("MASS") library(MASS) attach(Boston (adj) = 0.768 Deviance explained = 77.2% GCV = 1.0472 Scale est. = 1.0277 n = 506 mgcv包的bam函数
1.2K10编辑于 2021-12-18 - 来自专栏医学和生信笔记
批次效应去除之combat和removebatcheffect
combat 首先用sva包的ComBat函数去批次： library(sva) ## Loading required package: mgcv ## Loading required package : nlme ## This is mgcv 1.8-41. For overview type 'help("mgcv-package")'. ## Loading required package: genefilter ## Loading required
2.8K20编辑于 2023-08-30 - 来自专栏2022【生信零基础入门】
R 语言 安装DESeq2，dplyr 包遇到报错的彻底解决方案
:/Program Files/R/R-4.1.0/library packages: class, cluster, foreign, lattice, MASS, Matrix, mgcv
3K00编辑于 2022-10-04 - 来自专栏机器学习AI算法工程
R语言实现混合模型
在R语言中我们使用mgcv包中的lmer函数来完成这项工作。首先载入faraway包以便读取psid数据集，然后加载mgcv包，再将年份数据中心化以方便解释模型，最后用lmer函数进行建模。 1 -7 5 31 12 M 7500 72 1 -6 6 31 12 M 8000 73 1 -5 library(mgcv
4.9K70发布于 2018-03-14 - 来自专栏数据指象
2019天猫双11销售额预测：2583.387亿
confidence", level=0.95) 在置信度为95%的条件下预测gmv区间：[1627.233， 2399.937] 4.2，非线性的广义相加模型预测，对非线性的拟合会好一点 > library(mgcv
73610编辑于 2022-04-27 - 来自专栏cloudskyme
跟我一起ggplot2（1）
# (b). method = "gam": GAM 在大数据时比loess高效，需要载入 mgcv 包 library(mgcv) qplot(carat, price, data = dsmall,
2.8K80发布于 2018-03-20 - 来自专栏生信探索
如何优雅地管理R包
⬇ (unknown size) ├─sva 3.46.0 ✨ ⬇ (unknown size) │ ├─mgcv 1.8-42 │ │ ├─
91220编辑于 2023-04-17 - 来自专栏小汪Waud
R包来源及安装
Program Files/R/R-4.0.5/library packages: boot, class, cluster, KernSmooth, lattice, MASS, Matrix, mgcv
2.4K20编辑于 2023-02-16 - 来自专栏生信技能树
为什么R4.0版本内置的R包那么多
grid" "KernSmooth" [13] "lattice" "MASS" "Matrix" "methods" [17] "mgcv
99530发布于 2020-07-30 - 来自专栏素质云笔记
R语言︱线性混合模型理论与案例探究（固定效应&随机效应）
在R语言中我们使用mgcv包中的lmer函数来完成这项工作。首先载入faraway包以便读取psid数据集，然后加载mgcv包，再将年份数据中心化以方便解释模型，最后用lmer函数进行建模。
22K76发布于 2019-05-26 - 来自专栏全栈程序员必看
r语言 固定效应模型_r语言coef函数
在R语言中我们使用mgcv包中的lmer函数来完成这项工作。首先载入faraway包以便读取psid数据集，然后加载mgcv包，再将年份数据中心化以方便解释模型，最后用lmer函数进行建模。
6.5K30编辑于 2022-11-17 - 来自专栏Listenlii的生物信息笔记
ISME：近缘海洋细菌季节性生态位分化
使用mgcv 包的广义可加模型GAM对季节性变化的ASV进行了拟合。 使用propr包检验一个给定属内的类群是否共变，从而可以共享时间生态位。
87040编辑于 2022-05-18 - 来自专栏文献分享及代码学习
单细胞转录组学轨迹分析解析2-Slingshot代码解析
.#### Attaching package: 'mclust'## The following object is masked from 'package:mgcv':#### mvncl1
1.9K30编辑于 2023-11-07 - 来自专栏单细胞天地
表达矩阵处理—表达QC(reads)
rprojroot_1.3-2 rjson_0.2.15 GenomeInfoDbData_1.0.0 ## [109] diptest_0.75-7 mgcv
1.2K30发布于 2020-03-31 - 来自专栏脑电信号科研科普
Cerebral Cortex: 大脑的功能发育与成长环境紧密相关
利用R 包mgcv 进行了分析。
68610发布于 2020-11-19
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