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开源化学信息学工具包(Open Access Cheminformatics Toolkits)
//www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/ChemmineR.html ChemmineR是一种用于分析流行统计编程环境R中药物样小分子数据的cheminformatics
3.2K31发布于 2021-02-01 - 来自专栏DrugOne
AI设计药物，泡沫还是未来？
图片来源: Dissecting the Hype With Cheminformatics[3] 基于AI技术或许可以加速先导化合物优化，规避专利等，其实和之前的信息化技术是一样，只是辅助工具，不应该过度吹嘘 其中核心的生成设计(Generative Design)应该也是ligand-based的分子生成模型, 所以它招聘熟悉使用化学信息学工具的人: Knowledge of cheminformatics AI新药研发头部公司创纪录，"图片造假术"正加速救命药问世 http://www.mittrchina.com/news/4215 [3] Dissecting the Hype With Cheminformatics http://practicalcheminformatics.blogspot.com/2019/09/dissecting-hype-with-cheminformatics.html [4] Deep
88070发布于 2021-02-02 🧪 化学信息学的新革命：让分子结构分析变得如此简单！
今天要为大家介绍一个革命性的工具——Cheminformatics Microservice V3，它彻底改变了我们处理化学结构的方式！ 开放科学的典范 完全开源 整个软件栈，包括源代码和部署资源，都在GitHub上完全开源：https://github.com/Steinbeck-Lab/cheminformatics-microservice 结语 Cheminformatics Microservice V3不仅仅是一个工具，更是化学研究民主化的里程碑。
15110编辑于 2026-01-08- 来自专栏智能生信
J. Cheminform. | GraphSol：预测接触图助力蛋白质溶解度预测
今天给大家介绍中山大学杨跃东教授课题组发表在Journal of Cheminformatics上的一篇论文。 J Cheminformatics 13, 7 (2021). https://doi.org/10.1186/s13321-021-00488-1
96810发布于 2021-03-03 AI+Drug 文献速递 | PSV-PPO 算法：通过实时 SMILES 验证提升强化学习在药物设计中的分子生成有效性与多样性
fragment attention transformer for E(3)-equivariant multi-organ toxicity prediction 期刊: Journal of Cheminformatics Generating diversity and securing completeness in algorithmic retrosynthesis 期刊: Journal of Cheminformatics Hyperparameter optimization and neural architecture search algorithms for graph Neural Networks in cheminformatics
16710编辑于 2026-01-08AI+Drug 文献速递 | 基于自适应子结构感知专家模型的分子性质预测新突破
drug‑induced hepatotoxicity knowledgebase and graph neural network‑based prediction model 期刊: Journal of Cheminformatics A beginner’s approach to deep learning applied to VS and MD techniques 期刊: Journal of Cheminformatics
16710编辑于 2026-01-08- 来自专栏Python中文社区
Python科学计算与数据分析库/包大全
RDKit - Cheminformatics and Machine Learning Software.
2K70发布于 2018-01-31 - 来自专栏DrugOne
J. Cheminform. | 基于活性悬崖感知强化学习的全新药物设计
DRUGAI 今天为大家介绍的是来自清华大学和微软研究院发表于Journal of Cheminformatics的一篇论文。
40510编辑于 2025-05-04 AI+Drug 文献速递 | hERGAT结合GAT和GRU，以预测hERG通道阻断剂，解决了现有模型在性能和可解释性上的不足
using graph attention mechanism through atom- and molecule-level interaction analyses 期刊：Journal of Cheminformatics 8. kMoL: an open-source machine and federated learning library for drug discovery 期刊：Journal of Cheminformatics
27010编辑于 2026-01-08- 来自专栏DrugOne
Elsevier的Greg Landrum访谈 | 成功的开源化学信息软(RDKit)的要素是什么？
参考资料 Interview with Greg Landrum at Elsevier: What are the ingredients of a successful Open Source cheminformatics chemistry/interview-with-greg-landrum-at-elsevier-what-are-the-ingredients-of-a-successful-open-source-cheminformatics-software
1.1K50发布于 2021-02-02 - 来自专栏DrugScience
超量化合物库筛选策略–P4
Journal of Cheminformatics, 2020, 12(1):64. [2] https://github.com/rdkit/rdkit/blob/master/Data/Functional_Group_Hierarchy.txt
59310编辑于 2022-05-17 - 来自专栏AI启蒙研究院
《我不是药神》与AI研制新药
Advances上发表了《Deep reinforcement learning for de novo drug design》（基于深度强化学习的新药设计）、以及2017年Journal of Cheminformatics
97740发布于 2019-07-31 AI+Drug 文献速递 | DyRAMO结合了贝叶斯优化和生成模型，实现了多目标优化与预测可靠性的平衡
GNINA 1.3: the next increment in molecular docking with deep learning Journal of Cheminformatics https
11310编辑于 2026-01-08- 来自专栏机器学习与统计学
「交叉验证」到底如何选择K值？
Journal of cheminformatics, 6(1), p.10. [2] Zhang, Y. and Yang, Y., 2015.
4K20发布于 2019-04-08 - 来自专栏DrugOne
AI大模型驱动的智能化学结构分割框架ChemSAM
与帝国理工学院的合作论文“Automated molecular structure segmentation from documents using ChemSAM”发表在国际顶级化学信息学期刊Journal of Cheminformatics
66910编辑于 2024-03-26 AI+Drug 文献速递 | 基于分子指纹BERT与分形图神经网络的分子性质预测新方法，在多数据集上刷新性能上限
Hyperparameter optimization and neural architecture search algorithms for graph Neural Networks in cheminformatics
21610编辑于 2026-01-08- 来自专栏智能生信
J Cheminform｜DeepGraphMolGen：一种多目标的计算策略，图卷积和强化学习方法，用于生成具有理想性质的分子
作者 | 庞超 编辑 | 龙文韬 校对 | 李仲深 今天给大家介绍的是利物浦大学的Yash Khemchandani等人发表在Journal of Cheminformatics上的论文“DeepGraphMolGen
1K10发布于 2021-02-04 AI+Drug 文献速递 | 分子对接、分子生成、扩散模型、药靶相互作用…
Conformal Prediction-based Machine Learning in Cheminformatics: Current Applications and New Challenges
12910编辑于 2026-01-08- 来自专栏智药邦
药物发现中的深度学习
上发表综述论文Deep learning in drug discovery: a futuristic modality to materialize the large datasets for cheminformatics Deep learning in drug discovery: a futuristic modality to materialize the large datasets for cheminformatics
83420编辑于 2023-02-14 - 来自专栏智药邦
JCI｜基于子结构的神经机器翻译预测逆合成反应
2021年4月13日，Neves BJ等人在Journal of Cheminformatics杂志发表文章，文章使用分子指纹将分子表示为一段基于子结构的"句子"，通过学习子结构水平上的化学变化来预测逆合成反应 and Juyong Lee,Substructure-based neural machine translation for retrosynthetic prediction,Journal of Cheminformatics
84020发布于 2021-11-26
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