假设我有以下data.frame,它由多行(并不是全部显示在这里)和31列组成。第一个被标记为"gene_ID“,从第二列一直到第三十列,它们都有奇怪的名字,如下所示:
|gene_ID | weird1| weird2|all_the_way_to | weird30|
|:-------|------:|------:|:--------------|-------:|
|BPK282x | 4| 1|... | 7|
|BPK282y | 5| 2|... | 8|
|BPK282z | 6| 3|... | 9|我想用这样的模式重命名所有30列的名称: TPM_1、TPM_2、TPM_3、TPM_4.....TPM_30,结果如下表所示:
|gene_ID | TPM_1| TPM_2|all_the_way_to | TPM_3|
|:-------|-----:|-----:|:--------------|-----:|
|BPK282x | 4| 1|... | 7|
|BPK282y | 5| 2|... | 8|
|BPK282z | 6| 3|... | 9| 我可以通过以下命令分别重命名这些列:
names(data.frame) <- c("gene_ID", "TPM_1", "TPM_2", "TPM_3", ..., "TPM_30")然而,我想知道是否有一种方法可以通过使用一个函数来自动化这个过程,该函数可以在列名上使用类似于算术级数的东西。换句话说,我正在尝试用一种模式(TPM_followed by A number)来重命名我的列,因为列名应该是"TPM_n“、"TPM_n+1”、"TPM_n+2“、”TPM_n+3",一直到"TPM_n+30“。
发布于 2016-07-28 16:48:57
您可以使用paste0
colnames(df) <- paste0("TPM_", 1:30)
#[1] "TPM_1" "TPM_2" "TPM_3" "TPM_4" "TPM_5" "TPM_6" "TPM_7" "TPM_8" "TPM_9"
#[10]"TPM_10" "TPM_11" "TPM_12" TPM_13" "TPM_14" "TPM_15" "TPM_16" "TPM_17" "TPM_18"
#[19]"TPM_19" TPM_20" "TPM_21" "TPM_22" "TPM_23" "TPM_24" "TPM_25" "TPM_26" "TPM_27"
#[28] "TPM_28" "TPM_29" "TPM_30"您始终可以指定要更改的列的索引
colnames(df)[2:31] <- paste0("TPM_", 1:30)发布于 2016-07-28 16:49:06
我们可以使用paste。
colnames(df1)[-1] <- paste0("TPM_", head(seq_along(df1),-1))
colnames(df1)
#[1] "gene_ID" "TPM_1" "TPM_2" 在这里,我们只命名倒数第二列。OP提到第一列是"gene_ID“。此外,当数据集发生变化时,这是更一般的情况,我们不需要手动计数1、2、3、4等来检查是否有30列或100列。
数据
df1 <- structure(list(gene_ID = c("BPK282x", "BPK282y", "BPK282z"),
weird1 = 4:6, weird2 = 1:3), .Names = c("gene_ID", "weird1",
"weird2"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -3L))发布于 2016-07-28 16:50:13
使用paste组合字符串和列中的数字级数(例如seq_along)。在标准iris数据集中使用所需的输出:
names(iris) <- paste("TMP", seq_along(iris), sep = "_")
https://stackoverflow.com/questions/38631359
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