问使用epitools中的oddsratio()计算R中的赔率比时出错
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Stack Overflow用户

提问于 2017-08-01 23:31:36

回答 1查看 1.2K关注 0票数 2

我正在尝试计算暴露在焦虑率上的风险因素水平的优势比，这些数据是由以下因素产生的：

data<-structure(list(exposure = structure(c(3L, 1L, 2L), .Label = c("mild", 
"severe", "unaffected"), class = "factor"), count_not_anxious = c(108, 
337, 203), count_anxious = c(8, 48, 76)), .Names = c("exposure", 
"count_not_anxious", "count_anxious"), row.names = c(NA, -3L), class = "data.frame")

看起来是这样的：

    exposure count_not_anxious count_anxious
1 unaffected               108             8
2       mild               337            48
3     severe               203            76

我整理了一些数据，专门用于'epitools‘包中的oddsratio()函数，但是oddsratio(data)生成了以下错误信息：

Error in nrow(x) : object 'x' not found

为什么会这样呢？我是不是误解了这个函数的数据应该如何排列？

提前感谢您的建议！

回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2017-08-01 23:39:29

看起来您可以通过将数据从三列数据帧转换为两行矩阵来完成此操作。

> dd <- as.matrix(data[,-1])  ## drop first column
> rownames(dd) <- data[,1]
> oddsratio(dd)

结果：

$data
           count_not_anxious count_anxious Total
unaffected               108             8   116
mild                     337            48   385
severe                   203            76   279
Total                    648           132   780

$measure
                        NA
odds ratio with 95% C.I. estimate    lower    upper
              unaffected 1.000000       NA       NA
              mild       1.891296 0.911011  4.46757
              severe     4.956366 2.432386 11.56705

$p.value
            NA
two-sided      midp.exact fisher.exact   chi.square
  unaffected           NA           NA           NA
  mild       9.001770e-02 1.289249e-01 9.505682e-02
  severe     1.579224e-06 1.755645e-06 6.787096e-06

$correction
[1] FALSE

attr(,"method")
[1] "median-unbiased estimate & mid-p exact CI"

票数 1

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/45441963

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