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问Neo4j效率问题: Cypher查询永远运行
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Stack Overflow用户

提问于 2018-03-06 15:26:56

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我有一个大小为~ 70Gb的Neo4j数据库。它具有相同结构的8数据集，只是节点不同。下面给出的一个简单的Cypher查询从一个数据集中检索一些数据，需要花费很长时间才能运行。数据集中没有那么多节点，只有几千个。下面是查询：

MATCH (c:Cell)-[ex:EXPRESSES]->(g:Gene)
WHERE c.DATASET = "cd1_e165" AND g.geneName = "1010001B22Rik" 
RETURN c.tsneX, c.tsneY, ex.expr, c.cellId

总共有大量的:EXPRESSES关系，但如果我们仅限于c.DATASET，我相信它应该运行得更快。也许这个问题与我在每个:Cell中都有c.DATASET属性，而不是将其作为一种索引有关。可以做些什么来加快查询速度？

发布于 2018-03-06 17:11:15

首先，您应该在这两个属性上使用索引。

 CREATE INDEX ON :Cell(DATASET);
 CREATE INDEX ON :Gene(geneName);

接下来，我会像这样重写查询(不确定这是否有帮助，但这对我来说更有意义，cypher的行为通常就像你期望的那样，在这种情况下，它应该使用索引，而不是开始搜索所有可能的路径)：

MATCH (c:Cell{DATASET:'cd1_e165'})-[ex:EXPRESSES]->(g:Gene{geneName:'1010001B22Rik'})
RETURN c.tsneX, c.tsneY, ex.expr, c.cellId

正如InverseFalcon提到的：PROFILE和EXPLAIN总是可以帮助你理解你的查询做了什么，以及它是否符合你的期望。看看at the docs吧。

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/49125461

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