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问通过将dataframe中的条件匹配到一个"lookup“dataframe，在dataframe中创建一个新列
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Stack Overflow用户

提问于 2021-05-14 12:53:56

回答 2查看 28关注 0票数 0

我有一个数据帧

gene_symbols<- c ('ABL1', 'ABL1', 'Abl2', 'Accn1', 'Accn1')
Result_value<- c (1, 4, 5, 5, 2)
df<-data.frame(gene_symbols, Result_value)

在这个gene_symbols的数据框架中有重复，但它是人类和老鼠基因的混合体。

我还有第二个dataframe用作条件查找或字典

humanGene<-c('ABL1', 'ABL2', 'ACCN1')
mouseGene<-c('Abl1', 'Abl2', 'Accn1')
df2<-data.frame(humanGene, mouseGene)

我想在dataframe中创建一个新的列，这是仅有的人类基因之一。如果column1中有人类基因，它就会被保留下来，如果有老鼠基因，它就会被df2中的人类基因所取代。输出应如下所示：

我正在尝试使用条件查找

df$HumanGene <- ifelse(df$gene.symbols %in% df2$mouseGene, df2$humanGene, df$gene.symbols)

dataframe

回答 2

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2021-05-14 13:04:49

使用join和coalesce：

library(dplyr)

df %>%
  left_join(df2, by = c('gene_symbols' = 'mouseGene')) %>%
  mutate(humanGene = coalesce(humanGene, gene_symbols))

#  gene_symbols Result_value humanGene
#1         ABL1            1      ABL1
#2         ABL1            4      ABL1
#3         Abl2            5      ABL2
#4        Accn1            5     ACCN1
#5        Accn1            2     ACCN1

票数 1

Stack Overflow用户

发布于 2021-05-15 01:49:23

我们可以使用fcoalesce

library(data.table)
setDT(df)[df2, humanGene := fcoalesce(humanGene, gene_symbols), on = .(gene_symbols = mouseGene)]

票数 1

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/67529215

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