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问python中的散点图
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Stack Overflow用户

提问于 2020-05-22 14:20:52

回答 2查看 54关注 0票数 0

我试着用2-3个变量用不同的颜色表示散点图。我已经绘制了它，但我需要一个圆圈来围绕每个散布集群绘制一个边界，以便于表示。像下面这样的东西……如何做到这一点？

cluster-analysis

python

回答 2

Stack Overflow用户

发布于 2020-05-22 15:23:38

您可以使用K-Means聚类，这是创建此类聚类的最简单方法之一。您可以使用scikit-learn来简化这一过程。我也为你做了PCA，如果你不想做PCA，你可以去掉它，但我强烈建议你应用PCA。

from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.cluster import KMeans
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

def KMeansModel(n):
    pca = PCA(n_components=2)
    reduced_train_data = pca.fit_transform(train_data)
    KM = KMeans(n_clusters=n)
    KM.fit(reduced_train_data)
    plt.plot(reduced_train_data[:, 0], reduced_train_data[:, 1], 'k.', markersize=2)
    centroids = KM.cluster_centers_

    for ind,i in enumerate(centroids):
        class_inds=np.where(KM.labels_==ind)[0]
        max_dist=np.max(metrics.pairwise_distances(i, reduced_train_data[class_inds]))
        print(max_dist)
        plt.gca().add_artist(plt.Circle(i, max_dist, fill=False))
    plt.show()

out = ...

这里的n是您想要创建的集群的数量。

票数 0

Stack Overflow用户

发布于 2020-05-22 16:19:51

好的，有两个步骤:聚类和围绕集群构建一个形状。

您似乎已经对集群进行了排序。我建议您使用椭球体来限制群集的形状。有几种方法可以构造这样的椭球。

一种简单的方法是构造勒让德椭球，即以平均值$$ c_i = \frac1n \sum \vec x_i $$为中心的椭球，定义为$$ (x_i - c_i) a^{-1} (x_j - c_j) \le 1 $$，其中$$ a_{ij} = \frac1n (x _i - c_i) (x_j - c_j) (d+ 2) $$

您可能需要扩展椭球体，因为Legendre椭球体并不是约束所有点的高斯种子。

票数 0

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/61949619

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