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问使用HL7解析hl7apy时出错
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Stack Overflow用户

提问于 2016-09-29 11:17:00

回答 1查看 2K关注 0票数 1

我正在使用hl7apy解析python中的hl7文件，并遵循这链接。当我使用sample.hl7时，我得到了想要的结果，但是当我使用自己的hl7文件时，我得到了以下错误

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 2, in <module>
  File "hl7apy/parser.py", line 82, in parse_message
    m.structure_by_name)
  File "hl7apy/parser.py", line 144, in parse_segments
    reference))
  File "hl7apy/parser.py", line 189, in parse_segment
    reference=reference)
  File "hl7apy/core.py", line 1564, in __init__
    validation_level, traversal_parent)
  File "hl7apy/core.py", line 632, in __init__
    self._find_structure(reference)
  File "hl7apy/core.py", line 808, in _find_structure
    structure = ElementFinder.get_structure(self, reference)
  File "hl7apy/core.py", line 524, in get_structure
    raise InvalidName(element.classname, element.name)
  hl7apy.exceptions.InvalidName: Invalid name for Segment:

我不明白我做错了什么。

编辑: --这是我正在使用的示例。

MSH|^~\&|SQ|BIN|SMS|BIN|20121009151949||ORU^R01|120330003918|P|2.2
PID|1|K940462|T19022||TEIENT|JYSHEE|1957009|F|MR^^RM^MR^DR^MD^3216|7|0371 HOES LANE^0371 HOES LANE^NORTH CENTRE^FL^0854^INDIA^P^98|^UA^|(21)2-921|203960|ENG^ENGLISH^HL7096^ENG^ENGLISH^9CLAN|U|^HINU^|^^^T1M|05-1-900||||NW HAVEN||||PAS|NOTH CETRE|
PV1|1|I|BDE^BDE||||960^FALK,HENRY^^^MD|||MED|||||||960^FALK,HENRY^^^MD||22599|||||||||||||||||||||||||20160613102300||||
ORC|RE|10112|1705||D||^^^20103102300^216061102300||201208100924|PS||10084^BRUCE^PALTHROW|||201606310230|
OBR|1|10112|1705|1786-6^HEMOGOI A1C|||201606131300|201606131300||SGR||||201208056||1029^BONE,EAN|3-266-91|||||201280058||CH|F||R^^^2012070957|||||104^VRNEY,SCT|
OBX|1|NM|1856-6^LOINC^LN^HEMOGOI A1C^L||5.9|%|4.2-6.3||||F|||20160613|A^^L

代码: --这是我用来解析hl7文件的代码，也是我在解析上面提到的示例hl7文件时使用的代码。

from hl7apy import parser
from hl7apy.exceptions import UnsupportedVersion

hl7 = open('ICD9.hl7', 'r').read()

try:
    m = parser.parse_message(hl7)
except UnsupportedVersion:
    m = parser.parse_message(hl7.replace("n", "r"))

python

hl7

hl7-v2

回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2016-09-29 11:39:07

您应该在这里显示来自您的文件的消息，以获得明确的答案。

但最可能的原因是，您的文件的内容不遵循HL7规则。您确定使用了正确的段分隔符(ASCII 13或HEX0D)吗？您使用非标准段名吗？

只要与免费在线HL7消息验证核对一下，就会发现

ID  ELEMENT_TYPE POSITION   LINE_NO VALIDATION ERROR
1   Field        MSH.9.3    1       Component required
2   Field        PID.7      2       Invalid date time format : '1957009'
3   Component    PID.9.7    2       Invalid table entry value : '3216' for table Name Type
4   Component    PID.9.7    2       Value '3216' length (4) exceed limit (1)
5   Component    PID.11.6   2       Invalid table entry value : 'INDIA' for table Country Code
6   Component    PID.11.6   2       Value 'INDIA' length (5) exceed limit (3)
7   Field        PID.12     2       Field should not contain component(s)
8   Component    PID.18.1   2       Field required but has no value.
9   Field        ORC.5      4       Invalid table entry value : 'D' for table Order status
10  Component    ORC.7.4    4       Invalid date time format : '20103102300'
11  Component    ORC.7.5    4       Invalid date time format : '216061102300'
12  Field        ORC.15     4       Invalid date time format : '201606310230'
13  Field        OBR.14     5       Invalid date time format : '201208056'
14  Field        OBR.22     5       Invalid date time format : '201280058'
15  SubComponent OBR.27.1.1 5       Invalid numeric format : 'R'
16  Component    OBR.27.4   5       Invalid date time format : '2012070957'
17  Component    OBR.32.2   5       Invalid date time format : 'VRNEY,SCT'

但这并不能解释您的错误消息。您确定您读取了消息文件并解析了内容吗？

代码中有错误。它应该是

hl7.replace("\n", "\r")

如果要替换错误的分段分隔符。

票数 5

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/39768782

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