问使用Bash手动编辑文本或Fastq文件

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GNU可以这样做：

sed -i~ '2~4s/^.\{6\}//' file

address 2~4的意思是“从第2行开始，重复每4行”。

s的意思是替换，^匹配行开始，.匹配任何字符，\{6\}指定长度(“量词”)。替换字符串为空(//)。

-i~将文件替换到位，留下附加到文件名后的~备份。

我想awk在这方面是完美的：

$ awk 'NR%4==2 {gsub(/^.{6}/,"")} 1' file
@M03017:21:000000000
TCTCTCTCTCTCTCT
+
111>>B1FDFFF

这将删除4k+2位置中所有行中的前6个字符。

解释

• 如果记录的数量(行数)在4k+2表单上，则NR%4==2 {}会做一些事情。
• gsub(/^.{6}/,"")将第6个字符替换为空字符串。
• 将1计算为True，打印该行。