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问在R中将数据帧整形为列表
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Stack Overflow用户

提问于 2014-08-18 04:06:13

回答 2查看 372关注 0票数 0

我有一系列excel文件，如下所示，其中包含一个应急表：

         cns random
H3k       12  682
Not_H3k  343  30222

当我使用“gdata”库使用此命令读取该文件时，它将给出下表，它不再是应急表：

random <- read.xls ("analysis.xlsx", sheet = 1, header = TRUE)

              X    cns   random
        1     UTR  12    682
        2 Not_UTR 343  30222

我想对这些数据进行费舍尔测试，我如何将这些data.frame数据重组成一种应变表格式？

dataframe

contingency

回答 2

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2014-08-18 04:19:42

read.xls允许read.table的任何参数。特别是，您可以指定包含行名的列的数目。所以你可以用

random <- read.xls ("analysis.xlsx", sheet = 1, header = TRUE, row.names=1)

然后继续进行测试

票数 0

Stack Overflow用户

发布于 2014-08-18 05:46:02

您可以将fisher测试与您所拥有的dataframe：

random = structure(list(X = structure(c(2L, 1L), .Label = c("Not_UTR", 
"UTR"), class = "factor"), cns = c(12L, 343L), random = c(682L, 
30222L)), .Names = c("X", "cns", "random"), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-2L))

random
        X cns random
1     UTR  12    682
2 Not_UTR 343  30222

fisher.test(random[,-1])

        Fisher's Exact Test for Count Data

data:  ddf[, -1] 
p-value = 0.1433
alternative hypothesis: true odds ratio is not equal to 1 
95 percent confidence interval:
 0.7892877 2.7613943 
sample estimates:
odds ratio 
  1.550284

票数 0

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/25356212

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