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问在Imagej中自动识别被传输到ROIs中的对象
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Stack Overflow用户

提问于 2014-03-10 18:23:14

回答 1查看 1.6K关注 0票数 0

我在我的领域面临挑战，我需要一些建议。

我有一个有年轮的图像。

要查看我想要处理的照片，可以从我的dropbox：https://dl.dropboxusercontent.com/u/65873264/Sample.jpg上查看它

我想写一个宏/任务.在其中，程序将识别每个环，并将其标记为ROI。我试图使用一些插件来完成这个任务:模板匹配、特性查找和Visual。但这些戒指可能是极不稳定的。

我需要的是这样的东西:用分析粒子函数程序识别阈值图像上的所有血管(物体)。第二步很有趣:对于每个粒子，它检查周围是否有0.5毫米范围内的粒子。如果是的话，它会创建一个包含两个粒子的ROI，并在0.5毫米范围内搜索下一个粒子.

有一个微小的方法http://imagej.1557.x6.nabble.com/combine-particles-in-ROI-manager-automatically-td3692844.html，但在这里宏在这里首先计算两个系列粒子之间的差异，但我需要包括所有的粒子在0.5毫米范围内。

plugins

macros

imagej

回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2014-03-13 13:21:37

下面的ImageJ宏代码使用ImageJ中的极大值和最小值过滤器对示例图像中的粒子执行形态闭合操作，然后使用粒子分析仪创建ROIs：

open("https://dl.dropboxusercontent.com/u/65873264/Sample.jpg");
run("Duplicate...", "title=[Temporary Copy]");
run("8-bit");
setAutoThreshold("Default");
run("Analyze Particles...", "size=100-Infinity show=Masks clear include in_situ");
run("Maximum...", "radius=70");
run("Minimum...", "radius=70");
run("Analyze Particles...", "size=100-Infinity clear add");
selectWindow("Sample.jpg");
roiManager("Show All with labels");
roiManager("Show All");

票数 1

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/22308224

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