问运行paga时的ModuleNotFoundError
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Stack Overflow用户

提问于 2020-01-24 16:31:24

回答 1查看 328关注 0票数 2

我试着使用scanpy库运行下面的代码，但出于某种原因，它报告了一个错误。

ModuleNotFoundError: No module named 'igraph'

import numpy as np
import scanpy as sc 
import anndata

adata = anndata.AnnData(np.random.rand(300,300))
sc.tl.pca(adata, n_comps=30)
sc.pp.neighbors(adata, n_neighbors=16)
sc.tl.diffmap(adata, n_comps=50)
sc.tl.louvain(adata, resolution=1)
sc.pl.paga(adata)

python

numpy

scanpy

回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2020-01-28 01:06:07

只需使用以下命令运行即可

pip install python-igraph

票数 1

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/59900397

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