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问同一数据集中的多个Brown-Forsythe测试和配对
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Stack Overflow用户

提问于 2020-06-05 20:55:25

回答 1查看 43关注 0票数 0

我的实验有36个比较，3个间隔，21个数据点每隔室。数据集有2268个数据集。总共。第一行如下所示：

Comparison  Value   Compartment 
A   -0.715126087    1  
A   -0.481391603    2 
A   0.374693449 1  
A   null    2  
A   0.857450232 1  
A   null    2  
A   -1.608637992    3
A   -1.670859336    3  
A   -1.731618976    3
...    
AJ  -5.84850106 3

我对每项比较进行了一次方差分析，并检验了假设，但在某些比较中有违规之处。我想运行一个非参数Brown-Forsythe F*测试，然后进行成对比较。我的尝试：

if(!require(onewaytests)){install.packages("onewaytests")} # for Brown-Forsythe Test
if(!require(tidyverse)){install.packages("tidyverse")}
if(!require(broom)){install.packages("broom")}

fm3 <- my_data %>% 
  group_by(Comparison) %>% 
  do(multitst = paircomp(bf.test(Value ~ Compartment, data = .)))
fm3 %>% tidy(multitst)

问题: fm3不是创建的，因为它一碰到第一个没有统计意义的比较就会停止运行。这是我得到的错误：

误差在paircomp.owt中(bf.test(值~室，：成对比较)不能进行，因为差异没有统计学意义(α=0.0 5)。

希望:在这样的表中有一个输出：

Comparison  term  comparison  estimate  conf.low  conf.high  adj.p.value
1   A   Compartment 1-2 3.360531    2.9495551   3.7715075   2.023126e-11
2   A   Compartment 3-2 3.537098    3.1293925   3.9448041   2.023126e-11
3   A   Compartment 3-1 0.176567    -0.2382312  0.5913652   5.779274e-01
...
108 AJ  Compartment 3-1 4.50731363  2.85507469  6.1595525749    1.954819e-07

有人能帮忙吗？提前感谢！

tidyverse

tidy

broom

for-loop

回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2020-06-09 00:49:06

您可以包含一个ifelse()语句，在比较没有意义时填充NA，当比较没有显着性时填充结果。

  Not familiar with Brown-Forsythe test, but my go-to in such cases is a randomization test.  I guess the decision should be based upon how much information is being lost in using this particular non-parametric test.

票数 0

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/62223978

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