如何使用H5LTget_attribute_string函数？
我在HDF论坛上问过这个问题，但还没有收到任何答复。所以我想在这里碰碰运气。
我已经在Python (h5py)中创建了一个小的测试文件，并希望使用H5LTget_attribute_string函数从它读取一个属性。但是，我不知道如何使用这个函数。
我的测试文件是这样的。
HDF5 "attr.h5" {
GROUP "/" {
DATASET "my_dataset" {
DATATYPE H5T_STD_I64LE
DATASPACE SIMPLE { ( 12 ) / ( 12 ) }
DATA {
(0): 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11
}
ATTRIBUTE "string_attr" {
DATATYPE H5T_STRING {
STRSIZE H5T_VARIABLE;
STRPAD H5T_STR_NULLTERM;
CSET H5T_CSET_UTF8;
CTYPE H5T_C_S1;
}
DATASPACE SCALAR
DATA {
(0): "this is a string"
}
}
}
}
}在我看来，在属性中，我需要分配一个缓冲区，并将缓冲区的地址作为最后一个参数传递，然后H5LT_GET_ATTRIBUTE函数将填充缓冲区。因此，我的第一次尝试就是这样。
#include <assert.h>
#include <stdlib.h>
#include "hdf5.h"
#include "hdf5_hl.h"
int main()
{
herr_t status;
hid_t file_id = H5Fopen("attr.h5", H5F_ACC_RDONLY, H5P_DEFAULT);
assert(file_id >= 0);
char string[1024]; // assume buffer is large enough;
fprintf(stderr, "string : %s\n", string);
fprintf(stderr, "pointer: %p\n", string);
fprintf(stderr, "---- reading attribute ----\n");
status = H5LTget_attribute_string(file_id, "my_dataset",
"string_attr", string);
assert(status >= 0);
fprintf(stderr, "string : %s\n", string);
fprintf(stderr, "pointer: %p\n", string);
status = H5Fclose(file_id);
assert(status >= 0);
}但是，这并没有像预期的那样工作，请参见下面的输出。
string :
pointer: 0x7ffe3f7ec770
---- reading attribute ----
string : @B�k2V
pointer: 0x7ffe3f7ec770经过一些搜索和实验，我发现最后一个参数应该是缓冲区的地址。然后，H5LT_GET_ATTRIBUTE函数将使缓冲区指向实际属性值。下面的函数是用警告进行编译的，但是它提供了正确的输出。
#include <assert.h>
#include <stdlib.h>
#include "hdf5.h"
#include "hdf5_hl.h"
int main()
{
herr_t status;
hid_t file_id = H5Fopen("attr.h5", H5F_ACC_RDONLY, H5P_DEFAULT);
assert(file_id >= 0);
char* string = NULL;
fprintf(stderr, "string : %s\n", string);
fprintf(stderr, "pointer: %p\n", string);
fprintf(stderr, "---- reading attribute ----\n");
status = H5LTget_attribute_string(file_id, "my_dataset",
"string_attr", &string);
assert(status >= 0);
fprintf(stderr, "string : %s\n", string);
fprintf(stderr, "pointer: %p\n", string);
status = H5Fclose(file_id);
assert(status >= 0);
}输出
string : (null)
pointer: (nil)
---- reading attribute ----
string : this is a string
pointer: 0x559e9e3d1240现在我非常高兴像这样使用它，我可以将其转换到**char以消除警告，但我想确定这是预期的行为。理想情况下，文档应该更新。
所以我的问题是：
- 第二个例子正确吗？
string缓冲区中的数据有效的时间有多长？也就是说，HDF库何时释放内存？(例如，当文件关闭时)- 在使用字符串数据之前，我应该使用
strcpy来复制它吗？
回答 2
Stack Overflow用户
发布于 2020-10-29 22:21:11
由Scot (来自HDF组)担任尖头：
如果使用H5LTget_attribute_string (H5T_VARIABLE)读取可变长度字符串，则不需要分配字符串，只需传入指针，库将处理分配。如果您正在读取一个固定长度的字符串，则需要分配一个“足够大”的字符串。
所以，(1)在我看来，你的第二种方法是可以的。
至于(2)和(3)，我敢打赌您应该负责释放缓冲区，所以不需要复制它。但是，可以使用调试器检查库是否正在访问缓冲区，或者更好地使用valgrind查找内存泄漏(当您尝试不访问缓冲区时)。
Stack Overflow用户
发布于 2020-10-26 17:30:46
我不做HDF5，但是我做了足够的C来给你一些答案，很高的百分比是你想要的。
- 是第二个例子对吗？
是的。首先是因为它返回正确的预期结果，其次是因为任何将填充字符串(又名：char *)的库都需要您提供指针的地址(又名：char **)。
string缓冲区中的数据有效多长时间？
只要你的程序运行，它是有效的。这个内存已经为您分配了合适的大小，因此它在您的程序的整个生命周期中都是有效的，但是现在是您释放它的责任。如果您需要更多的详细信息，请回复/评论该消息，这样说，我们将帮助您。
- 在使用字符串数据之前，我应该使用
strcpy来复制字符串数据吗？
不，你没有把记忆分配给你，你可以把它保存下来:-)
下一步我建议你做：
- 既然你在他们的医生中发现了问题，你应该联系他们并告诉他们。
https://stackoverflow.com/questions/64467420
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