ggplot2 box_plot添加观察数
ggplot2 box_plot添加观察数
提问于 2020-12-07 22:54:38
我有这个问题，应该是微不足道的，但到目前为止，我看到的例子都没有帮助。我在R中有这个融化的数据，我想用box_plot做一个geom_points。到目前为止，代码是有效的。
head(df3)
microRNAs variable value
1 geneA LC1_average_TPM 520075.23
2 geneB LC1_average_TPM 315802.96
3 geneC LC1_average_TPM 13356.56
4 geneD LC1_average_TPM 13348.82
5 geneE LC1_average_TPM 13331.13
6 geneF LC1_average_TPM 13309.27
ggplot(df3, aes(x=variable, y=log(value), fill=variable)) +
geom_boxplot(aes(fill = variable))+
geom_point(shape = 21, alpha = 0.9, position=position_jitterdodge(jitter.width = 3, jitter.height = 0)) +
scale_fill_brewer(palette = "Spectral") + scale_y_continuous(limits=c(0,15), breaks=seq(0,15,1)) + theme(axis.text.x=element_blank()) + ylab("log2(Expression TPM)") + xlab ("Libraries")
我的问题是，我想在这个情节中增加一些观察。观测结果由每个DF3$变量得到的数据点数决定。
回答 1
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2020-12-08 00:04:32
如果您使用mutate，正如我的注释所建议的那样，它是可行的，但是您将得到多个重复的n值，您需要使用summarsie并创建一个单独的表。您将使用geom_text()参数将其添加到data调用中。我将您的data.frame命名为"df“，但在您的情况下为df3进行了调整。
counts_df <-
df %>%
group_by(variable) %>%
summarise(group_n = length(variable))
df %>%
ggplot(aes(x=variable, y=log(value), fill=variable)) +
geom_boxplot(aes(fill = variable))+
# this is what you want to add < ----
geom_text(
data = counts_df,
aes(variable, y=10,
label=group_n))+
geom_point(shape = 21, alpha = 0.9, position=position_jitterdodge(jitter.width = 3, jitter.height = 0)) +
scale_fill_brewer(palette = "Spectral") +
scale_y_continuous(limits=c(0,15), breaks=seq(0,15,1)) +
theme(axis.text.x=element_blank()) +
ylab("log2(Expression TPM)") +
xlab ("Libraries")它产生这个可怕的情节，调整美学和n的位置使用y参数。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/65190630
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