问熊猫read_csv无法分隔标签分隔的数据。
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Stack Overflow用户

提问于 2022-01-28 21:58:51

回答 1查看 165关注 0票数 0

我有一些输入文件如下所示：

GENE       CHR      START       STOP  NSNPS  NPARAM      N        ZSTAT            P
2541473       1    1109286    1133315      2       1  15000       3.8023   7.1694e-05
512150        1    1152288    1167447      1       1  15000       3.2101   0.00066347
3588581       1    1177826    1182102      1       1  15000       3.2727   0.00053256

我正在导入这样的文件：

df = pd.read_csv('myfile.out', sep='\t')

但是所有的数据都会被读取到一个列中。我尝试过将文件格式更改为encoding='utf-8'、encoding='utf-16-le'、encoding='utf-16-be'，但这是行不通的。sep=' '的分离会将数据分隔成太多的列，但它会分离。有办法正确地读取这些数据吗？

python

pandas

回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2022-01-28 22:02:33

尝试使用\s+ (读取为“一个或多个空白字符”)作为分隔符：

df = pd.read_csv('myfile.out', sep='\s+')

票数 2

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/70900745

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