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问如何在MATLAB中对.csv文件的每一行应用复杂的函数？
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Stack Overflow用户

提问于 2022-01-02 17:18:28

回答 1查看 49关注 0票数 0

我想从Toker等人的论文中应用带有particualr函数(chaos；https://figshare.com/s/80891dfb34c6ee9c8b34)的外部代码。2020年(https://www.nature.com/articles/s42003-019-0715-9#Sec1)为了检验我的数据是随机的还是混沌的。

我尝试过循环，for，cellfun，但是在这种情况下，这些循环都不起作用。

当我试图使用以下代码时：

T = readtable('ibfrq3.csv');
C = table2array(T);
D = num2cell(C, 2);
rowSums = cellfun(@sum, D)
chaos = cellfun(@chaos, D)

我收到了三个错误：

Unable to perform assignment because the size of the left side is 1-by-14 and the size of the right side is
1-by-3.

Error in chaos>surrogate (line 989)
        surr(k,:)=unwrap(horzcat(st,parts{randperm(j)},en));

Error in chaos (line 157)
            [surr, params] = surrogate(zscore(surr_y), num_surr, 'CPP', 1, 1);

有趣的是，我能够使函数工作，但只适用于不同的行(方法是将它们复制到方括号中并标记为y(例如，y = [1,2,3,4,5,6,7,8,9,5,6,7,8,8]) )。

我想要的输出是一个字符串(或者理想情况下是一个添加到我的.csv中的列)，它的chaos函数输出(每一行一个单词：“随机”或“混沌”(取决于结果))。

我的数据可以在这里获得：https://drive.google.com/file/d/1I2BChrv0iqNr1dcEKTQKxKF7DDl_hF23/view?usp=sharing，.csv由不同时期的等位基因频率组成。

编辑:尝试

numRows = size(C, 1);
for row = 1:numRows
    result(row) = chaos(C(row,:));
end

产生了类似于上面的错误。

我还尝试在我的数据上逐行运行代码，以检查哪一行使用

row1 = C(1,:);
chaos(row1)

每一排。有趣的是，它为第1行、第3-9行、第11-100行提供了理想的输出。第二行和第十行与其他行没有区别，不包含任何特殊字符或值。我不知道他们怎么了。

function

matlab

rows

chaos

回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2022-01-05 10:01:50

cellfun (及其近亲arrayfun)在这里不合适，因为它们分别对数组的每个元素应用一个函数，而您希望对每一行应用一个函数。另外，您正在为chaos分配一个值，它已经是一个函数的名称，这很可能导致混淆行为。

如果C是一个m数值数组，而chaos是一个以行向量作为输入并返回标量值作为输出的函数，那么

numRows = size(C, 1);
for row = 1:numRows
    result(row) = chaos(C(row,:));
end

将创建一个1×m向量result，其中包含每个C行的函数输出。

如果chaos函数返回字符向量，则需要将结果存储在单元格数组中，方法是将循环中的行更改为

result{row} = chaos(C(row,:));

但是，添加到问题中的错误消息表明还有另一个问题，因为它告诉我们chaos函数中的操作正在失败。如果您说当您一次给出一行数据时，chaos似乎正常工作，那么要么您的数组C不包含您认为它所做的事情，要么是有一行数据导致它由于某种原因而失败。你需要调试这个。首先，您可以在循环中添加一个disp(row)，这将显示导致错误的C行。

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/70558096

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