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问为R中的热图选择列
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Stack Overflow用户

提问于 2010-06-02 22:41:31

回答 2查看 1.9K关注 0票数 1

我再次需要你的帮助:)

我编写了一个R脚本，它从给定的以制表符分隔的txt或xls文件中生成热图。目前，我在xls文件中手动删除了热图中不想要的所有列。现在我想把它自动化，但我不知道怎么做：

在所有xls文件中，感兴趣的列都以相同的开头，后面跟着一个单独的名称：

xls-文件1: L1_tpm_xxxx L2_tpm_xxxx L3_tpm_xxxx

xls-文件2: L1_tpm_xxxx L2_tpm_xxxx L3_tpm_xxxx L4_tpm_xxxx L5_tpm_xxxx

你知道如何选择这些列吗？

在期待中感谢你，菲利普

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回答 2

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2010-06-02 23:32:31

您可以使用(如果您已在data.frame df中读取数据)：

df <- df[,grep("^L[[:digit:]]+_tpm.*",colnames(df))]

或者，您可以显式编写所需的列：

df <- df[,c("L1_tpm_xxxx","L2_tpm_xxxx","L3_tpm_xxxx")]

等等。

下面的link非常有用；-)

票数 2

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Stack Overflow用户

发布于 2010-06-02 23:36:26

如果您认为列位置将跨excel工作表固定，这里最简单的解决方案是只使用列索引。例如，如果您使用read.table将一个以制表符分隔的文本文件作为data.frame导入，然后决定只保留前两列，则可以这样做：

data <- read.table("path_to_file.txt", header=T, sep="\t")
data <- data[,1:2]

票数 0

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/2958751

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