问使用h5py压缩现有文件

EN

HDF组提供了一个set of tools来转换、显示、分析、编辑和重新打包您的HDF5文件。

您可以使用h5repack实用程序压缩现有的hdf5文件。您还可以使用相同的实用程序更改块大小。

可以从命令行使用h5repack。

h5repack file1 file2 //移除文件1的已记账空间，并将其保存为file2。

h5repack -v -l CHUNK=1024 file1 file2 //将1024的分块应用于file1

h5repack -v -l CHUNK=1024 GZIP=5 file1 file2 //生成1024的数据块并使用GZIP5级压缩进行压缩

h5repack --help \获取可用的帮助文档

Detailed documentation也是可用的。

在h5py中，压缩非常容易使用。查看Wiki HowTo和Compression指南。基本上，它应该是这样的：

ds = myfile.create_dataset('ds', shape, dtype, compression='lzf')

还有一些关于如何选择块大小来优化文件大小/访问的问题，请参阅我链接的压缩指南。

我不记得默认情况下打开的是哪种压缩。