虚拟筛选-1 数据库下载

数据库筛选和下载

数据库下载

本次主要针对的靶点蛋白的配体是NAD，所以在下载天然产物库的时候，进行初步筛选，首先是结构正确，其次是可以购买到有现货的药物。但是从底下的图片也可以看到数据库是非常庞大的所以需要进一步筛选优化否则数据库太大对接时间会比较长

数据库小分子下载

进一步筛选小分子集

进一步的根据亲疏水性纵坐标是亲疏水值越小越亲水越大越疏水然后根据分子量NAD是600多所以筛选的分子一定要可以占据结合腔所以选择的分子量范围是375-500

之后就是下载

直接点击下载如果命令行使用觉得有困难的话可以使用网页连接下载

下载过程

下载之后会获得一个网址的txt文件；类似于这样

下载网址

之后把每一个网址复制在浏览器中进行下载即可