网络药理学学习记录2

AutoDock半柔性对接

1.准备文件和设置工作目录

（1）设置该文件夹为工作目录。

注：该文件夹所有路径均要求为英文，不能出现中文和特殊字符。将下载好的“autogrid4，autodock4，adt”程序以及“5nb8.pdb”文件拷贝到此文件夹下。

（2）去除蛋白质上的其他结构和原子

删除水分子：remove solvent。